七月十七日（8月22日），咸丰帝驾崩，载淳即位，成为同治帝。当天，钮祜禄氏率领琳贵太妃等前往咸丰帝灵前祭奠，而同治帝的生母叶赫那拉氏（即后来的慈禧太后）因身份问题并未一同前往。随后，钮祜禄氏被尊为“母后皇太后”，叶赫那拉氏被尊为“圣母皇太后”，分别获得了“慈安”和“慈禧”的徽号。

在咸丰帝去世之初，由于礼节上的争执，慈安与慈禧之间关系紧张。肃顺等人试图利用这一矛盾，但他们的专横行为反而促使慈安与慈禧结成了同盟。为了夺回权力，两宫太后秘密策划行动，派遣心腹急召恭亲王奕?前往热河，共同商讨对策。

八月初十日，御史董元醇上书请求两宫太后暂理朝政，并建议在亲王中选拔辅政大臣。慈禧对此表示赞同，并试图实施这一提议。然而，载垣等人坚决反对，认为“我朝向无皇太后垂帘之仪”，并撰写了批驳董元醇奏折的谕旨。慈禧对此非常愤怒，但慈安从中调和，建议暂时妥协。

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九月十八日，慈安和慈禧在热河行宫命令醇郡王奕譞起草了一份谕旨，并将其藏于自己的衣服内，准备回到北京后立即发布。为了分散八大臣的力量，她们巧妙地安排了行程，使得载垣、端华、肃顺三人被分隔开来。

九月二十三日，慈安、慈禧与同治帝从热河返回北京。途中，胜保奏请两宫太后亲理大政，并另 简 近 支亲王辅政。二十九日 未 时 ，慈安与同治帝同乘一辆车，慈禧随后，一行人进入德胜门回宫。

九月三十日，大学士贾桢、周祖培，户部尚书沈兆霖，刑部尚书赵光联名上书，请求两宫太后亲操政权。当天，两宫太后以同治帝的名义发布了早已准备好的上谕，宣布将载垣、端华、肃顺革去爵职，并予以逮捕。不久，肃顺被处斩，载垣、端华被赐令自尽，其余大臣如景寿、穆荫、匡源、杜翰、焦佑瀛等均被革职或发配边疆服役。

四、两宫垂帘

咸丰十一年（1861年）十一月初一（12月2日），随着同治帝载淳正式即位，两宫皇太后慈安与慈禧开始了她们长达数十年的垂帘听政。这一天，载淳在养心殿首次与两宫皇太后一起垂帘听政，标志着“二宫垂帘，亲王议政”的格局正式确立。同时，恭亲王奕?被任命为议政王、军机大臣，并管理总理各国事务衙门，年号也被改为“同治”。

同治元年（1862年）正月，慈安与慈禧在慈宁宫接受了同治帝及王公大臣们的朝贺，这一仪式此后成为了每年的传统。同年四月二十五日（5月23日），同治帝为两宫皇太后上徽号册宝，正式尊称慈安为“慈安皇太后”，她也因此获得了“东太后”、“东佛爷”的称号。

慈安的性格被描述为“浑厚”，在面对大臣时，她通常沉默寡言，需要慈禧在一旁为其解读奏疏内容。因此，在两宫垂帘期间，慈安经常让位于“性机敏，锐于任事”的慈禧。然而，慈安的信任并没有让慈禧独揽大权，后者仍然会在涉及重大朝政决定时征求慈安的意见，显示出对嫡庶之分的尊重。恭亲王奕?的存在也为两人之间的合作提供了一定程度的协调作用。